離子色譜儀可對樣品中無機及部分有機陰、陽離子（包括氟離子、氯離子、溴離子、亞硝酸根離子、硝酸根離子、硫酸根離子、磷酸根離子、氨根離子、鋰離子、鈉離子、鉀離子、鎂離子、鈣離子等）進行定性和定量分析。廣泛應用于環境、電力、衛生、能源、農業、食品飲料、醫藥、檢驗、化學、工業、科研等領域。
進樣分析作為離子色譜儀實驗的關鍵一環，操作時更要謹慎：
1、用去離子水將注射器、針頭清洗干凈。(注意：進樣及清洗過程中手不要觸及針頭及注射器內壁, 以防止引入污染)
2、用盛去離子水的洗瓶將進樣口清洗2-3次。
3、將閥打到“進樣”位置, 用注射器各吸取1-2ml 去離子水、樣品依次注入將定量環清洗3次(注意：注射器中不能有氣泡) 。再吸取1-2ml(一般取1.0ml) 樣品注入，迅速將閥打至“分析”位置(注意動作要快，在1s 內完成) ，同時按動“啟動”按鈕采集信號或儀器開始自動采集信號，并分析樣品。
4、樣品出峰完畢，點擊“手動停止”按鈕或F10或到工作站中?采集時間?的設定時間停止譜圖信號采集，于彈出的“另存為對話框”中更改譜圖文件名，將譜圖保存。
5、針對不同的樣品，重復上述操作。
離子色譜儀實驗完畢后，將泵關閉，將色譜柱卸下，兩端用柱接頭擰緊將其密封，放于儀器內保存。(如果是陰離子檢測時要再將電流旋鈕關閉)
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